ミツクリザメの「ミツクリ（箕作）」は、東京大学で日本人初の動物学教授となった箕作佳吉（みつくりかきち）の名前に由来する。
イギリスの貿易商であったアラン・オーストンは、箕作教授の研究に協力し、捕獲した生物を研究所に寄贈していた。
今まで見たことのないこの魚も、箕作教授の研究所に寄贈され、箕作の名に因んで「ミツクリザメ（箕作鮫）」と名付けられた。
その後、アメリカのデイビッド・スター・ジョーダンによって新種の魚であることが確認され、学名には箕作とオーストンの名前から「Mitsukurina owstoni」と名付けられている。
ミツクリザメのほか、箕作教授の名に因んだ生物の和名には、「ミツクリエビ」「ミツクリエナガチョウチンアンコウ」がある。