腑に落ちないの語源・由来

腑に落ちないの「腑」は、「はらわた」「臓腑」のこと。
「腑」は「考え」や「心が宿るところ」と考えられ、「心」「心の底」という意味がある。
そこから、「人の意見などが心に入ってこない（納得できない）」という意味で、「腑に落ちない」となった。
肯定形の「腑に落ちる」は、明治時代の文献にも見られ、「納得がいく」「納得する」という意味で用いることは誤用ではない。

出典：腑に落ちない – 語源由来辞典

「腑」とは、内臓のこと。転じて、「心」や「心の底」を意味する。
心の底に落ちないうところから、納得できない意味となった。

出典：腑に落ちない – 故事ことわざ辞典