ウィンナーコーヒーの「ウィンナー」は、ソーセージの「ウインナー」と同じく、「ウィーン風の」を意味するドイツ語「Wiener」に由来し、このコーヒーの飲み方が、オーストリアのウィーンが発祥であることからの呼称である。
当然のことだが、ウィーンでは「ウィンナーコーヒー」と呼んでおらず、「アインシュペナー」や「カフェー・ミット・シュラークオーバース」などが、日本で言う「ウィンナーコーヒー」に近い。
海外では、エスプレッソにホイップクリームを載せた「エスプレッソ・コン・パンナ」が、「ウィーン風コーヒー」の意味で「café vienne（カフェ・ヴィエンヌ）」や「café viennois（カフェ・ヴィエノワ）」と呼ばれることがある。